Feulgen stain 的原理是DNA经温和的弱酸（例如盐酸）水解后，嘌呤碱与脱氧核糖间的糖苷键被打开，并且使脱氧核糖与磷酸间的磷酯键断开，在脱氧核糖的一端形成游离的醛基。染色后用SO2水洗片，目的是洗去多余的非特异性色素及扩散的染料。

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